TVアニメ放送開始から16年、「HI-EVOLUTION」シリーズがついに完結。力を失いながらも贖罪の10年を過ごしたエウレカは、スカブコーラルを生み出す能力を持つ少女・アイリスと出会い、彼女を守る決意をする。デューイ・ノヴァクの望む世界崩壊が迫る中、二人で歩む旅の果てに待つものとは。