現代に恐竜をよみがえらせた一大テーマパーク“ディノズアイランド”が東京にオープン！子どもも大人も恐竜にムチュ～！しんのすけたちはその頃、シロが出会った小さな恐竜“ナナ”と特別な夏を過ごし、新たな絆も生まれる野原一家。そんなナナを巡って、アンビリ～バボ～な争奪戦がスタート！バブル・オドロキ―は「ある秘密」がバレる前に、あの手この手でナナの居場所を探す。ひと夏を一緒に過ごした、ナナの秘密とは!?
シリーズ初の恐竜超大作ムービー！しんのすけとシロ、カスカベ防衛隊が、ナナを守るために東京・渋谷で大奮闘！超巨大恐竜に立ち向かった先に、笑いと涙が止まらないクライマックスが待ち受ける！